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Analyse des mécanismes de résistance
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Etude de clonalité
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Les entérobactéries productrices de carbapénèmase (EPC) restent rares en France. Elles doivent cependant être activement recherchées par les laboratoires de biologie médicale, publics ou privés, et faire l'objet d'un signalement (portail eSIN : Déclaration des BHRe).
1) Quelles souches adresser au CNR ? cliquez ici pour connaitre les critères d'envoi
Avec les développements récents des méthodes de détection des EPC, nombreux laboratoires sont en mesure de détecter efficacement et d’identifier les EPC. Cependant, dans le but d’évaluer l’ampleur des phénomènes épidémiques par rapport aux cas dits sporadiques et pour conserver une vision globale et actualisée de
l’épidémiologie française (notamment pour adapter les tests diagnostiques), le CNR souhaite toujours recevoir rapidement la première souche suspecte d'EPC de chaque nouveau patient, quelle que soit l’espèce. Le CNR déterminera alors le génotype et identifiera (type et variant) l’enzyme produite par chacune de ces souches. Merci de ne nous adresser qu’une seule souche/par an/même patient/même carbapénèmase quelque soit l’identification bactérienne.
2) Modalités d’envoi des souches
a) Chaque souche envoyée au CNR devra être accompagnée d’un formulaire de demande (formulaire V2-2023 en PDF informatisé) à raison d’un formulaire par souche identifiée. Toutes les rubriques suivies d’un astérisque rouge doivent être renseignées. Le formulaire doit obligatoirement être joint à la souche. Le prélèvement doit nous parvenir dans les 30 jours suivant l’enregistrement de la demande.
L’accusé de bonne réception des souches et la diffusion des résultats se faisant uniquement par courriel, une adresse email valide doit être fournie. Afin d’optimiser le rendu des résultats, nous vous conseillons d’utiliser une adresse email « générique » pour le laboratoire (accessible par l’ensemble des biologistes du laboratoire). Une adresse email « générique » sera toujours préférée à une adresse personnelle.
b) La souche pure doit être envoyée dans un tube gélosé ou sur une boite de ré-isolement sur gélose qui doit être fermée et l’identité du patient clairement indiqué.
c) Les souches doivent être envoyées dans un triple emballage selon la réglementation en vigueur pour le transport des échantillons infectieux.
3) Modalités d’expertise des souches et rendu des résultats
De façon générale, la procédure est la suivante :
a) Accusé réception de la souche par email lors de l’enregistrement de la souche par le CNR
b) Résultats : disponibles 48h ouvrées après réception de la souche (si la souche est arrivée un vendredi, le résultat est disponible le mardi).
- Souche non EPC : Vous recevrez un mail contenant le résultat complet. Ce résultat sera et restera également disponible sur le site (serveur de résultat) avec l’email et le mot de passe que vous avez créé. Il comprend la recherche de carbapénèmase et diverses CMI*.
- Souche EPC :
1. Vous recevrez un mail contenant le résultat partiel vous indiquant le type de carbapénèmase identifié.
2. Le séquençage du gène codant pour la carbapénèmase, variant exact et séquence type (ST), sera effectué le plus rapidement possible. Le délai des résultats définitifs peut prendre jusqu’à 3 semaines.
Vous serez destinataire du résultat complet DÈS SA DISPONIBILITÉ. Ce résultat sera et restera également disponible sur le serveur de résultat.
* CMI réalisées systématiquement sur les souches hors prélèvements de dépistage en environnementaux (depuis le 1/04/2024)
• Aztréonam - Aztréonam+avibactam - Amikacine
•Céfépime-Céfépime+enmétazobactam - Céfépime+taniborbactam - Céfépime+zidebactam
• Ceftazidime - Ceftazidime+avibactam
• Ceftolozane+tazobactam - Ciprofloxacine - Colistine
• Ertapénème - Eravacycline - Gentamicine
• Imipénème - Imipénème+relebactam - Levofloxacine
• Méropénème - Méropénème+vaborbactam
• Témocilline - Tygécycline
CMI Céfidérocol pour NDM, VIM et IMP uniquement
OBTENTION DU RESULTAT : Aucun résultat papier n’est adressé par voie postale. L’ensemble des résultats est consultable via le serveur sécurisé du CNR (https://www.cnr-resistance-antibiotiques.fr). |